R/Bioconductor

急にR/Bioconductorというソフト(??)を扱わなければならない羽目に陥った。セミナーに出るのに、手前のパソコンにR/Bioconductorをインストールしておくようにとのお達しである。わかりにくいが、プログラム作成用のeditorのように見える。

メモを貼る。
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RとBioconductorのインストール

(1) Rのインストール
以下のWebサイトを参考にRをインストールしてください。

- Rの公式Webサイト: http://www.r-project.org/
- Windowsバイナリダウンロード:
http://cran.md.tsukuba.ac.jp/bin/windows/base/
- RjpWiki: http://www.okada.jp.org/RWiki/

(2) Bioconductorのインストール
Rを起動し、コンソールで、
source("http://bioconductor.org/getBioC.R")
getBioC(groupName="all")
のように実行し、Bioconductorをインストールしてください。

注意として、
source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
では不十分ですので、必ずgetBioC.Rを実行してください。

Wekaのインストール
以下のWebサイトを参考にWekaをインストールしてください。
- 公式Webサイト: http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/
- ダウンロード: http://www.cs.waikato.ac.nz/ml/weka/index_downloading.html
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それゆけBioinformatics
これでも読んで雰囲気に慣れよう。

Ｒ−備忘録
というのもある。