マイクロRNAの現況＝サンガーセンターのmiRBase

マイクロRNAの現況

MicroRNA Listing for Homo sapiens

サンガーセンターのmiRBase

1. 現在リリース12.0でありヒトのmiRNAはhsa-let-7iに始まってmiR-944が最終登録：欠番も多い
2. ヒトの総数は８５１個：個々のmiRNAやそのターゲットが知りたいときは
   
   MicroRNA Listing for Homo sapiens　851 microRNAs (711 native)
3. let-7には現在16種類のsubfamilyがあることになっている。アジレントのアレイではうまく見分けることができるのだろうか、心配だ
4. Ambion社のアレイ：(miRCURY LNATM miRNA ArrayHomo sapiens)( miRBASE ver.11.0) 866(98%)が搭載
5. Agilent社のアレイ：((Human miRNA マイクロアレイ キット (V2))723種類のヒトmiRNA および 76種類のヒトウィルスmiRNA を搭載（ Sanger miRBase v.10.1）
6. 例えばlet 7aのターゲット遺伝子が知りたければ「ここ」を見る。
7. 逆にmycをターゲットとするmiRNAが知りたいときは「こちら」を見る。
8. 以上サンガーが一番充実しているという話。