膵内分泌腫瘍のゲノム解析：Vogelsteinの新作サイエンス

ちょっと古い論文であり、膵内分泌腫瘍のゲノム解析という特殊な研究であるがVogelsteinに敬意を示してnoteする。一般の膵癌とは随分違うものだ。PDACとは通常の膵癌（ductal adenocarcinoma）の事である。PanNETとはpancreatic neuroendocline tumorである。68例もよく集めて解析したものだ。
通常の膵癌でのKRAS　100％やp53　85％というのも、これは確定頻度に近いのだろうな。

先日大腸癌のKRAS変異頻度について面白いデータを教えてもらった。論文の上では実に様々な数字が出ていたものだが、最近は例の分子標的（アービタックスやベクティビックス）の投薬適応条件としてまずKRAS変異を調べることが必須になってきたので、実は武田やメルクには膨大なデータが存在する。４０％というのが現状数千例の変異頻度ということだ。先行していた諸外国の値も実は４０％だったという。KRAS変異：日本も世界と変わらず40％なんだ。

(注解)この４０％は「大腸癌全体におけるKRAS変異の頻度」ではないということを付記しておかなければならないことに気がついた。なぜなら調査対象は分子標的（アービタックスやベクティビックス）を受ける患者群なのである。手術不能の進行癌か術後再発転移群なのである。悪性度がより高いサブグループにおける頻度が４０％であったと理解すべきなのだね。

Published Online 20 January 2011
Science 4 March 2011:
Vol. 331 no. 6021 pp. 1199-1203

DAXX/ATRX, MEN1, and mTOR Pathway Genes Are Frequently Altered in Pancreatic Neuroendocrine Tumors

Yuchen Jiao, Chanjuan Shi, Barish H. Edil, Roeland F. de Wilde, David S. Klimstra, Anirban Maitra, Richard D. Schulick, Laura H. Tang, Christopher L. Wolfgang, Michael A. Choti, Victor E. Velculescu, Luis A. Diaz Jr., Bert Vogelstein, Kenneth W. Kinzler1, Ralph H. Hruban, and Nickolas Papadopoulos

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Abstract

Pancreatic neuroendocrine tumors (PanNETs) are a rare but clinically important form of pancreatic neoplasia. To explore the genetic basis of PanNETs, we determined the exomic sequences of 10 nonfamilial PanNETs and then screened the most commonly mutated genes in 58 additional PanNETs. The most frequently mutated genes specify proteins implicated in chromatin remodeling: 44% of the tumors had somatic inactivating mutations in MEN1, which encodes menin, a component of a histone methyltransferase complex, and 43% had mutations in genes encoding either of the two subunits of a transcription/chromatin remodeling complex consisting of DAXX (death-domain–associated protein) and ATRX (α thalassemia/mental retardation syndrome X-linked). Clinically, mutations in the MEN1 and DAXX/ATRX genes were associated with better prognosis. We also found mutations in genes in the mTOR (mammalian target of rapamycin) pathway in 14% of the tumors, a finding that could potentially be used to stratify patients for treatment with mTOR inhibitors.