今回は胃癌でARID1A変異というnature genetics

ARID(1A)はここのところ様々な癌腫で変異が報告され始めた遺伝子である。今回ファイザー製薬と香港の大学から胃癌について報告された。余り頻度が高くないようである。そのためMSI陽性症例では高頻度であるなどサブセット解析を行っている。
今回22例の胃癌をdeep sequenceしているのだが、２２例中６例にARID1Aの変異が認められているとのことだ。30%弱ということになる。そしてこれは頻度でいくとp53に次いでPTENとならんで２番目に高い頻度ということである。

Nature Genetics

Exome sequencing identifies frequent mutation of ARID1A in molecular subtypes of gastric cancer

Kai Wang, Junsuo Kan, Siu Tsan Yuen, Stephanie T Shi, Kent Man Chu, Simon Law, Tsun Leung Chan, Zhengyan Kan, Annie S Y Chan, Wai Yin Tsui, Siu Po Lee, Siu Lun Ho, Anthony K W Chan, Grace H W Cheng, Peter C Roberts, Paul A Rejto, Neil W Gibson, David J Pocalyko, Mao Mao, Jiangchun Xu & Suet Yi Leung

Received 18 May 2011
Accepted 23 September 2011
Published online 30 October 2011

これまでの報告では

☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆
2011年8月8日月曜日
肝細胞癌で変異を起こす遺伝子ARID2・・・アジアでは否定的？
AT rich interactive domain 1A (SWI-like)
Nature Genetics (2011)
　　　Published online 07 August 2011

Inactivating mutations of the chromatin remodeling gene ARID2 in hepatocellular carcinoma

☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆
2010年11月3日水曜日
卵巣の明細胞癌で高率に変異を起こす遺伝子ARID1A：NEJM続報

ARID1A Mutations in Endometriosis-Associated Ovarian Carcinomas

N Engl J Med 2010; 363:1532-1543October 14, 201

☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆☆