2012年2月13日月曜日

KIF5B-RET fusion:新しい融合遺伝子みつかる。肺癌の1%内外

肺腺癌におけるRET 融合遺伝子が3つのグループからnature medicineに報告された。頻度的には悲しいくらい低値(0.8-1.9-2.0%)であるが甲状腺腫瘍で用いられるret inhibitorが有効である可能性を秘めているのが素晴らしい。融合遺伝子はみんな頑張って見つけてくれるがいずれも頻度が低いのが残念だね。

1) がんセンターグループ

1.9% (6 out of 319) expressed KIF5B-RET fusion transcripts

28歳から71歳で男女は半々いずれも非喫煙者(never) 中分化以上の腺癌

(いいたかないけど、このがんセンターの著者一覧はなんなの! 本当にすべての部局がこの研究に関与したのでしょうか? みっともないことこの上ない。各部署、各部門の代表者勢揃いではないですか。年度末、国への報告書に間に合ってよかったね、それぞれの皆さん・・・・といったところだな。がんセンターの研究系列・指揮系統はいったいどうなっているんだろう。かなり疑問だな。)

2)自治医大グループ

1529例の肺癌から44例の ALKがらみの融合例、13 例の ROS1-fusionがらみの融合例を見いだした。さらにKIF5B- RETを12例見いだした。これは0.8%(12/1529)ということになる。がんセンターと合わせると 1%内外といったところかな。

ちとややこしいのでabstract全文

  • Through an integrated molecular- and histopathology-based screening system, we performed a screening for fusions of anaplastic lymphoma kinase (ALK) and c-ros oncogene 1, receptor tyrosine kinase (ROS1) in 1,529 lung cancers and identified 44 ALK-fusion–positive and 13 ROS1-fusion–positive adenocarcinomas, including for unidentified fusion partnersfor ROS1. In addition, we discovered previously unidentified kinase fusions that may be promising for molecular-targeted therapy, kinesin family member 5B (KIF5B)-ret proto-oncogene (RET) and coiled-coil domain containing 6 (CCDC6)-RET,in 14 adenocarcinomas. A multivariate analysis of 1,116 adenocarcinomas containing these 71 kinase-fusion–positive adenocarcinomas identified four independent factors that are indicators of poor prognosis: age ≥50 years, male sex, high pathological stage and negative kinase-fusion status.

3)諸外国グループ

C2orf44-ALK in a colorectal cancer sample and KIF5B-RET in a lung adenocarcinomaを新たに見つけた。

Further screening of 561 lung adenocarcinomas identified 11 additional tumors with KIF5B-RET gene fusions (2.0%; 95% CI 0.8–3.1%)


Brief Communications

1) KIF5B-RET fusions in lung adenocarcinoma

Takashi Kohno, Hitoshi Ichikawa, Yasushi Totoki, Kazuki Yasuda, Masaki Hiramoto, Takao Nammo, Hiromi Sakamoto, Koji Tsuta, Koh Furuta, Yoko Shimada, Reika Iwakawa, Hideaki Ogiwara, Takahiro Oike, Masato Enari, Aaron J Schetter, Hirokazu Okayama, Aage Haugen, Vidar Skaug, Suenori Chiku, Itaru Yamanaka, Yasuhito Arai, Shun-ichi Watanabe, Ikuo Sekine, Seishi Ogawa, Curtis C Harris, Hitoshi Tsuda, Teruhiko Yoshida, Jun Yokota & Tatsuhiro Shibata

Published online: 12 February 2012 |

2) Identification of new ALK and RET gene fusions from colorectal and lung cancer biopsies

Doron Lipson, Marzia Capelletti, Roman Yelensky, Geoff Otto, Alex Parker, Mirna Jarosz, John A Curran, Sohail Balasubramanian, Troy Bloom, Kristina W Brennan, Amy Donahue, Sean R Downing, Garrett M Frampton, Lazaro Garcia, Frank Juhn, Kathy C Mitchell, Emily White, Jared White, Zac Zwirko, Tamar Peretz, Hovav Nechushtan, Lior Soussan-Gutman, Jhingook Kim, Hidefumi Sasaki, Hyeong Ryul Kim, Seung-il Park, Dalia Ercan, Christine E Sheehan, Jeffrey S Ross, Maureen T Cronin, Pasi A Jänne & Philip J Stephens

3) RET, ROS1 and ALK fusions in lung cancer

Kengo Takeuchi, Manabu Soda, Yuki Togashi, Ritsuro Suzuki, Seiji Sakata, Satoko Hatano, Reimi Asaka, Wakako Hamanaka, Hironori Ninomiya, Hirofumi Uehara, Young Lim Choi, Yukitoshi Satoh, Sakae Okumura, Ken Nakagawa, Hiroyuki Mano & Yuichi Ishikawa



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