chromothripsisとmicronucleiとchromoplexy：時代はどんどん進展しているぞ。

がんのゲノムシークエンス報告で衝撃的だったのがchromothripsisであったことは記憶に新しいが、時代はどんどん進んでいる。 最近では染色体崩壊（？）（chromothripsisとmicronucleiとchromoplexy）なる現象が次々知られて来た。

クロモスリプシスは骨腫瘍、小児の髄芽腫、神経芽細胞腫に認められ、一本かせいぜい二本の染色体が一挙にバラバラになる。再構成の過程で、欠失や転座などが起こるというイベントである。カタストロフィックな変化と記述されているが、細胞分裂のときに更にmicronucleiというものができ、不均等分裂につながったり、さらには今年のCellにchromothripsisがらみで、いくつもの遺伝子ゲノムが輪っかを作りこれをchromosome chainとよび、この現象をchromoplexy（plexyというのはギリシャ語で「紡ぐ」という意味）と呼ぶというイベントが報告されている。

Cell, Volume 153, Issue 3, 666-677, 25 April 2013

Punctuated Evolution of Prostate Cancer Genomes

Sylvan C. Baca et al 

 これらの用語は少なくとも３年前の教科書には存在しない。時代はどんどん進んでいる。

以上はこの春のランダーの総説からのトピックであるが、この総説はワクワクするくらい面白いよ。

 ーーーーーーーーーーーーーーーーーーーー

2013年4月1日月曜日

春は総説が目白押し：Science & Cell

（１）まずはセル誌によるEric S. Landerの21ページの総説

Cell, Volume 153, Issue 1, 17-37, 28 March 2013

Lessons from the Cancer Genome

Levi A. Garraway, Eric S. Lander

Summary

Systematic studies of the cancer genome have exploded in recent years. These studies have revealed scores of new cancer genes, including many in processes not previously known to be causal targets in cancer. The genes affect cell signaling, chromatin, and epigenomic regulation; RNA splicing; protein homeostasis; metabolism; and lineage maturation. Still, cancer genomics is in its infancy. Much work remains to complete the mutational catalog in primary tumors and across the natural history of cancer, to connect recurrent genomic alterations to altered pathways and acquired cellular vulnerabilities, and to use this information to guide the development and application of therapies.

 ーーーーーーーーーーーーーーーーーーー

を今読んでいるが、これが実に面白い。