髄芽腫の突然変異数は平均11個：Vogelsteinのサイエンス

最近脳腫瘍に関する分子遺伝学の報告が多い。グリオブラストーマのCNVと突然変異の話、つい最近ではNatureの腫瘍血管と癌幹細胞の話（あっこれもglioblastomaであった）そして今回のサイエンスの髄芽腫である。髄芽腫を六行でまとめると・・・・

髄芽腫 medulloblastoma

• 小児の小脳虫部に好発し、第四脳室に浸潤し脳脊髄液を介して脊髄に転移するため極めて悪性度が高い。 近年になってようやく5年生存率が50%にまで上昇した。
• 病理所見 ：Homer-Wright型rosette
• 治療：腫瘍摘出術を行ない、術後に全脳および全脊髄への放射線照射とともに化学療法を行なう。

今回Vogelsteinグループの研究は

1. ＣＤＳの全シークエンス
2. アレイによるCNV(CNA)
3. miRNA (これはVogelsteinとしては珍しいのでは・・・・？）
   
   
   

興味深いのはこれまで乳癌、大腸癌、膵癌で一腫瘍平均70個内外の突然変異を見出していたのに対し、この小児脳腫瘍では平均11個の突然変異しか認めなかったこと及びヒストンのメチル化遺伝子であるMLL2 あるいはMLL3が16％に変異していたことである。


Published Online 16 December 2010

Science DOI: 10.1126/science.1198056

Research Article

The Genetic Landscape of the Childhood Cancer Medulloblastoma

D. Williams Parsons1,2,*, Meng Li1,*・・・・・, Nick Papadopoulos1, Bert Vogelstein1,‡, Kenneth W. Kinzler1,‡ and Victor E. Velculescu1,‡

Abstract

Medulloblastoma (MB) is the most common malignant brain tumor of children. To identify the genetic alterations in this tumor type, we searched for copy number alterations using high-density microarrays and sequenced all known protein-coding genes and miRNA genes using Sanger sequencing in a set of 22 MBs. We found that, on average, each tumor had 11 gene alterations, 5 to 10 times fewer than in the adult solid tumors that have been sequenced to date. In addition to alterations in the Hedgehog and Wnt pathways, our analysis led to the discovery of genes not previously known to be altered in MBs. Most notably, inactivating mutations of the histone-lysine N-methyltransferase genes MLL2 or MLL3 were identified in 16% of MB patients. These results demonstrate key differences between the genetic landscapes of adult and childhood cancers, highlight dysregulation of developmental pathways as an important mechanism underlying MBs, and identify a role for a specific type of histone methylation in human tumorigenesis.