PIK3CAはどれくらいの変異率か？

少し古いデータであるがPIK3CAはどれくらいの変異率かノートしておこう。2006年のBrit J Cancerである。

Minireview

British Journal of Cancer (2006) 94, 455–459.
Published online 31 January 2006

Mutation of the PIK3CA oncogene in human cancers

B Karakas¹, K E Bachman² and B H Park¹

たった4年前であるが　deep sequencingあるいはre-sequencingの前のデータであり、そう言う意味では古いのだ。いずれre-sequencing後のデータを付加した最新の表を作りたいね。

全体では15％（382/2551)である。15％の変異率というのはこの世界では充分高いのである。

頻度が高いのは肝臓癌（但し報告数も解析数も少ないので確定ではない）の35.6％ (26/73)
以下・・・・・

1. 乳癌　　　　　26% (195/750)（これは信頼性が極めて高い。10報告有り。ほとんどの報告が20％以上の変異率）
2. 大腸癌　 25% (94/369)（3報告である。最低でも13.6％であるから15％はあると思える）
3. 卵巣癌　　9% (35/380)　（こんなもんであろう）
4. 胃癌 　　　　　7% (24/338)　（4報告あり。大きなスタディでは4〜6%であるから、まあ５％が変異率であろう）

一方肺癌では変異が認められない。lung 2% (4/253)であり、この4例は例外的と見たほうが良さそうである。