肝細胞癌で変異を起こす遺伝子ARID2・・・アジアでは否定的？

AT rich interactive domain 1A (SWI-like)

ARIDという遺伝子がある。昨年暮れには卵巣癌で高頻度に変異を起こすことが報告されたのがARID1Aである。

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2010年11月3日水曜日

高率に変異を起こす遺伝子ARID1A：NEJM続報

卵巣の明細胞癌で高率に変異を起こす遺伝子ARID1Aについてサイエンスの報告をnoteしたが、NEJMにも同様の報告が載っていた。こちらも 55/119 (46%) であり、この遺伝子は知られている癌関連遺伝子の中でも極めて高率に再現性良く（といっても2報）変異を起こす遺伝子ということになるかもしれないね。追 加であるがendometorioid carcinoma（卵巣）でも10/33 (30%)と高率に変異を起こしている。

ARID1A Mutations in Endometriosis-Associated Ovarian Carcinomas

N Engl J Med 2010; 363:1532-1543October 14, 201

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AT rich interactive domain 2 (ARID, RFX-like)

今回C型肝炎由来の肝細胞癌で10%程度変異をおこすという報告がARID2であった。いずれもVogelsteinらのグループが報告しているのでややこしいが、更にややこしいのはこの遺伝子北米・ヨーロッパ系の肝細胞癌でないと変異がないようなのだ。中国の肝細胞癌では６１例調べても１例(1.6%)にしか変異を認めない。今ひとつわかりにくいNature Geneticsの報告である。どうしてNature Geneticsに通るのだろう？





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Nature Genetics (2011)

　　　Received 26 April 2011
　　　Accepted 14 July 2011
　　　Published online 07 August 2011

Inactivating mutations of the chromatin remodeling gene ARID2 in hepatocellular carcinoma

Meng Li, Hong Zhao, Xiaosong Zhang, Laura D Wood, Robert A Anders, Michael A Choti, Timothy M Pawlik, Hubert D Daniel, Rajesh Kannangai, G Johan A Offerhaus, Victor E Velculescu, Linfang Wang, Shibin Zhou, Bert Vogelstein, Ralph H Hruban, Nick Papadopoulos, Jianqiang Cai, Michael S Torbenson & Kenneth W Kinzler

Through exomic sequencing of ten hepatitis C virus (HCV)-associated hepatocellular carcinomas (HCC) and subsequent evaluation of additional affected individuals, we discovered novel inactivating mutations of ARID2 in four major subtypes of HCC (HCV-associated HCC, hepatitis B virus (HBV)-associated HCC, alcohol-associated HCC and HCC with no known etiology). Notably, 18.2% of individuals with HCV-associated HCC in the United States and Europe harbored ARID2 inactivation mutations, suggesting that ARID2 is a tumor suppressor gene that is relatively commonly mutated in this tumor subtype.