個人のOmicsと転写プロフィルを14ヶ月追いかける：Cell驚異の論文

個人のOmicsと転写プロフィルを14ヶ月追いかけるというとんでもない論文が登場した。スタンフォードの遺伝学教室からだが、この個人とはこの論文のコレポンであるMichael Snyder自身のことである。　

解析内容が詳細だ。1人がターゲットとはいえ系時的なテロメアの長さの変化、自己抗体のプロフィルの変化まで見ようという執拗さだ。サイトカインの系時的プロフィルもあれば、全ゲノムシークエンスやエクソームシークエンスは当たり前のようにしてある。

この14ヶ月の間にはSnyder 教授は Rhinovirusによる風邪をひいたり、糖尿病イベントが起こったりとそれなりの病的状態に罹患しているが、健康状態から病気罹患に移行するときのヒトの全プロフィルの変化が観察され、データが記録に残っているのだからスリリングではないか！

解析対象項目

1. EXTENDED EXPERIMENTAL PROCEDURES
2. Sample Collection
3. Human Rhinovirus and Respiratory Syncytial Virus Detection
4. Whole-Genome Sequencing
5. Whole-Exome Sequencing
6. Sanger DNA Sequencing
7. Whole-Transcriptome Sequencing: mRNA-Seq
8. Small RNA Sequencing: microRNA-Seq
9. PBMC and Serum Shotgun Proteome Profiling
10. Peptide Separation
11. Proteomics MS Analysis
12. Proteomics Data Processing and Analysis
13. Serum Metabolome Profiling
14. Metabolomics Data Processing and Analysis
15. Serum C-Reactive Protein and Plasma Insulin Enzyme-Linked ImmunoSorbant Assays
16. Serum Cytokine Profiling
17. Blood Glucose, Glycated HbA1c, and Triglyceride Measurement
18. Autoantibodyome Profiling
19. Telomere Length Assay
20. Genome Phasing
21. Variants Identified in RNA: Heteroallelic Expression and RNA Editing
22. Variants Identified in Proteins
23. Von Willebrand Factor Cleaving Protease Activity Assay
24. General Omics Analysis Framework and Result Summaries
25. Analysis Framework

Cell, Volume 148, Issue 6, 1293-1307, 16 March 2012

Personal Omics Profiling Reveals Dynamic Molecular and Medical Phenotypes

Tailoring Medicine with Supersized Omics

Michael Snyder and colleagues present the first personalized medicine study on an individual—Mike himself. Genome sequencing, transcription profiling, and quantitative metabolomic analyses for 14 months offers a comprehensive view of healthy and disease states, including two viral infections and the onset of type 2 diabetes.