ついに胃癌の分子分類４タイプ：nature

胃癌の分子分類４タイプというのが登場した。

1. EBV
2. MSI
3. GS
4. CIN

というのがその4タイプのニックネームである。特徴を簡単に・・・

1. EBV：EBVが陽性であるもの。PIK3CAの変異が認められメチル化が高度である。JAK2,CD272(PD-L1),PDCDILG2(PD-L2）の増幅を認める
2. MSI：マイクロサテライト不安定症例で変異を多く認める
3. GS：ゲノム安定しているタイプ：diffuseタイプに多い。RHOAの変異、 RHOファミリーの融合を認める。
4. CIN：染色体不安定症例：aneuploidyが顕著、レセプターチロシンキナーゼ遺伝子の増幅(+)

出所はCancer Genome Atlasからであり、ご想像通り日本人研究者の名前は事実上皆無である。この研究では295症例の胃腺癌症例が対象でありサンプルは韓国の国立癌センター、オンタリオ癌研等々13研究所から集められた（2010年から2012年にかけて）。618症例が集められたが、厳密なQCの結果275症例が却下された。

1. 114症例は病理学的検索で壊死や腫瘍量（体積比）が不足と判断
2. 117症例はRNAのqualityやDNA収量など分子評価で却下
3. 13症例では腫瘍と健常サンプルがgenotypeで不一致
4. 10症例では病理診断が今回の研究には不適切
5. 3症例は量的不適切
6. 18例他の理由で不適切であった。

343症例のうち48サンプルは化学療法が行われていたことがあとから判明した3ケース、更なる病理検索で不適切であると判断されたもの（今ひとつ判然としないこのあたり）などであり最終評価から省かれた。結局残った295症例では

1. intestinal type (196 例) ：diffuse type (69 例) 
2. T 1/2/3/4/X : 11/ 44 / 155 / 75 / 10
3. Stage I/II/III/IV/X : 32 / 116 / 111 / 20 / 16
4. 人種：最も多いのがロシア人の83人、次いでドイツとウクライナで39人　韓国は31人である。
5. 57人が死亡、31人が再発している

4タイプと組織学的亜型との関係が最も知りたい事項であろう。

Nature

(2014)

doi:10.1038/nature13480

Comprehensive molecular characterization of gastric adenocarcinoma

Received21 February 2014

Accepted13 May 2014

Published online23 July 2014 

 

もっと斬新なものを期待していたが、正直どこかで見たような分類であるなあ。予後や化学療法への関連（Her2とか）についてもっと読み込んでみたい。