4回ほどEric Landerの総説を紹介してみた。
まだ半分程度しか終わっていないが、ではここで以下の要約を読んで頂こう。
なんとまあスラスラ読めるのではないだろうか?もうすっかりおなじみの遺伝子名がずらずらと登場だ。
Abstract
Genetic changes underlying clear cell renal cell carcinoma
(ccRCC) include alterations in genes controlling cellular oxygen sensing
(for example, VHL) and the maintenance of chromatin states (for example, PBRM1).
We surveyed more than 400 tumours using different genomic platforms and
identified 19 significantly mutated genes. The PI(3)K/AKT pathway was
recurrently mutated, suggesting this pathway as a potential therapeutic
target. Widespread DNA hypomethylation was associated with mutation of
the H3K36 methyltransferase SETD2, and integrative analysis suggested that mutations involving the SWI/SNF chromatin remodelling complex (PBRM1, ARID1A, SMARCA4)
could have far-reaching effects on other pathways. Aggressive cancers
demonstrated evidence of a metabolic shift, involving downregulation of
genes involved in the TCA cycle, decreased AMPK and PTEN protein levels,
upregulation of the pentose phosphate pathway and the glutamine
transporter genes, increased acetyl-CoA carboxylase protein, and altered
promoter methylation of miR-21 (also known as MIR21) and GRB10.
Remodelling cellular metabolism thus constitutes a recurrent pattern in
ccRCC that correlates with tumour stage and severity and offers new
views on the opportunities for disease treatment.
このアブストラクトはいったいどの論文からとられたものなのだろうか? 先のEric Landerの総説に挙げてある参考文献の一つなのだろうか?
答えは「否」
これはEric Landerの総説から3ヶ月後、昨日(2013/6/23)natureにonline発表されたばかりの最新の腎癌(clear cell carcinoma)のdeep sequencing研究(400症例以上の解析!)のアブストラクトなのである。
どうだろう、いつか見た遺伝子名ばかりではなかろうか? 既視感あふれる、デジャブの塊ではないかい?
この最新の論文に現れる遺伝子名に違和感がないとすれば、癌の遺伝子に関する研究は、少なくともその登場遺伝子については完成の域にに近づいたと考えても良いのではないだろうか?
主役はすでにそろったということなのだろう。あとに続く論文にもこれらの遺伝子が主役として活躍するのだろう。
Nature (2013)
Received 25 October 2012
Accepted 24 April 2013
Published online23 June 2013
Comprehensive molecular characterization of clear cell renal cell carcinoma
The Cancer Genome Atlas Research Network
2 件のコメント:
、提示されている情報をありがとうございました常に成功挨拶
Obat Herbal Jantung Koroner さん
インドネシアの方のようですね。
わざわざ、どうもありがとうございます。
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