2010年12月19日日曜日

PIK3CAはどれくらいの変異率か?

少し古いデータであるがPIK3CAはどれくらいの変異率かノートしておこう。2006年のBrit J Cancerである。

Minireview

British Journal of Cancer (2006) 94, 455–459.
Published online 31 January 2006

Mutation of the PIK3CA oncogene in human cancers

B Karakas1, K E Bachman2 and B H Park1

たった4年前であるが deep sequencingあるいはre-sequencingの前のデータであり、そう言う意味では古いのだ。いずれre-sequencing後のデータを付加した最新の表を作りたいね。

全体では15%(382/2551)である。15%の変異率というのはこの世界では充分高いのである。

頻度が高いのは肝臓癌(但し報告数も解析数も少ないので確定ではない)の35.6% (26/73)

以下・・・・・
  1. 乳癌     26% (195/750)(これは信頼性が極めて高い。10報告有り。ほとんどの報告が20%以上の変異率)
  2. 大腸癌  25% (94/369)(3報告である。最低でも13.6%であるから15%はあると思える)
  3. 卵巣癌  9% (35/380) (こんなもんであろう)
  4. 胃癌      7% (24/338) (4報告あり。大きなスタディでは4〜6%であるから、まあ5%が変異率であろう)
一方肺癌では変異が認められない。lung 2% (4/253)であり、この4例は例外的と見たほうが良さそうである。

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