MicroRNA Listing for Homo sapiens
サンガーセンターのmiRBase
- 現在リリース12.0でありヒトのmiRNAはhsa-let-7iに始まってmiR-944が最終登録：欠番も多い
- ヒトの総数は８５１個：個々のmiRNAやそのターゲットが知りたいときは
- let-7には現在16種類のsubfamilyがあることになっている。アジレントのアレイではうまく見分けることができるのだろうか、心配だ
- Ambion社のアレイ：(miRCURY LNATM miRNA ArrayHomo sapiens)( miRBASE ver.11.0) 866(98%)が搭載
- Agilent社のアレイ：((Human miRNA マイクロアレイ キット (V2))723種類のヒトmiRNA および 76種類のヒトウィルスmiRNA を搭載（ Sanger miRBase v.10.1）
- 例えばlet 7aのターゲット遺伝子が知りたければ「ここ」を見る。
- 逆にmycをターゲットとするmiRNAが知りたいときは「こちら」を見る。
- 以上サンガーが一番充実しているという話。
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