気になる女声ボーカル

Alexis Cole
Angela Galuppo
Barbra Lica
Diana Krall
Diana Panton
Dinah Shore
Eliane Elias
Francesca Tando…
Halie Loren
Hilary Kole
Jane Monheit
Karen Souza
Karrin Allyson
Laura Fygi
Maci Miller
Malene Mortense…
Nicki Parrott
Sacha
Sally Night
Sarah Lenka
Simone (Jazz)
Simone Kopmajer
Stacey Kent
Yvonne Walter

すべてを聴いたことがあるわけではない。類縁検索したものである。小生は女声ボーカル（ヴォーカルね、本当は）が好きである。ヒトの好みは本当に様々であり、自分と全面的に同じ好みを持ったヒトなど、あたりまえだがやはりいない。
好きな女声ヴォーカリストをふるそうな順に数人書いてみる。


ジョニ・ミッチェル ：

最初に「青春の光と影」を聴いたのが中学生くらいであり、その後「ミンガス」「Wild Things Run Fast」が大学生か医者になりたて、2000年を超えてからも「Shine」を買ったなあ・・・映画「いちご白書」の「サークルゲーム」を作ったヒト（唱ったのはバフィー・セントメリー：Galileo Galileiではないよ）ですと紹介すると、あれかと思い出される方もいるだろう。でもジョニ・ミッチェルはその後がずっと凄い。ジャコ・パストリアスとのコラボなどとても良いです。10枚以上持っている。

バルバラ：

唯一好きなシャンソン歌手。この方の唄はとても好きだ。

ナデージュ：

おそらく知っているヒトはほとんどいないだろう。これまで知っているヒトを1人として知らない。でも10枚近く（ほとんど全てのアルバム）を持っている。全く話題にならないヒト。ネット情報もほとんど無い。だから歌っているのが誰なのか、どんな顔をしているのか、今もって小生全く知らない。だいたいフランス人であるかどうかも疑われているらしい。でも、とても好きだ。

クレモンティーヌ：

ここに挙げるのが恥ずかしいくらいの歌手に成り下がってしまったが、初期数枚(1980年台最後くらいか・・？）のフレンチ・ジャズはとても好きで今でも良く聴きます。21世紀になってからは全く買わなくなってしまった。

小生恥ずかしながらSarah Vaughan、Ella Fitzgerald 、Billie Holidayなどは重くて聴かないの。

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私の場合 「これいいよ、と教えてもらって良かった確率は高々二割といったところであろう。だからこそ、同好の志にお誘いしてみたい。今回のリストは比較的新しい人ばかりである。 ほとんど2010年以降のヒトである。20人くらいいるけど、この中に好きな名前が1人2人あれば、ひょっとすると拾いものが紛れ込んでいるかもしれませんよ。

現代はYoutubeの時代であるから、直ぐに確かめに行ける。これはありがたいシステムです。

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年末からお気に入りの曲は「This Happy Madness」という曲である。もともとはボサノバ・ナンバーであるが、それほどメジャーな曲ではないので、多くのシンガーのオムニバス・アルバムには入っていないことが多い。

この曲をクリスマスのころ、上のリストにもあるDiana Pantonの2012年のアルバムで聴いていたら再発見してしまったというわけだ。それ以来Stacey Kentのバージョン、Karrin Allysonのバージョンとお気に入りがどんどん増えて行く。フランク・シナトラがカルロス・ジョビンとコラボしている バージョンも気に入っている。

聴いてみてください。とくにKarrin AllysonのバージョンのYoutubeのCGグラフィックが気に入っている。この曲、英語の歌詞だと恋に舞い上がっている私・・・がその詩情であるが（これはこれで良い歌詞だ）、もともとのポルトガル語の原題は「Estrada Branca」 (白い路）という。その詩情はポルトガル語故に小生には不明であるが、このCGグラフィックが表徴する世界がそれであるなら、これはこれで素敵だと思う。出てくるボールがいとおしい。

緊急時の気道確保について：何歳になってもできるようにね

気管切開についてまとめてみた。小生が気管切開をすることなどめったにないが、でも年に1〜2回くらいは頼まれる。この頼まれるような状況は、待機的であるから、きちんとやりさえすれば問題は無いし、第一患者さんは靜かである。

問題は緊急時なのだ。緊急の気切を最後にやったのはいつだろう？3年くらい前になるだろうか？緊急気切を日常におこなうような医師はそうたくさんはいないと思う。そんな環境にはいない平凡な温和な医療環境にいる今の私のような医師でも、ある日突然そんな状況に遭遇するからこまるのである。医師というのはいきなり修羅場に遭遇し、その修羅場を乗り越え患者さんの命を救わなければいけないこともあるので、そのためにある程度の収入を保障されている部分があると小生など考えている。

気切というのは現状どうとらえられているのだろうか？ネットでみると気が滅入ってくる。最近の話題は緊急時は気切はダメで輪状甲状靱帯穿刺もしくは輪状甲状靱帯切開にせよということみたいである。訴訟や裁判の世界でいろいろかまびすしいようだ。なおここでは気管切開と輪状甲状靱帯切開を区別している。輪状甲状靱帯は通常気管切開する高さより上方にある。ある年齢より上の医師には馴染みがない場所であるが、小生は日常的に患者の頚部を触診することがある場合はその人の輪状甲状靱帯の位置を確認する癖を付けている。ヒトによって雰囲気が違うしね。

気管切開は緊急で死が差し迫っている状態すなわちCICV（can’t intubate, can’t ventilate）には適応にならないとされる。CICVの時には輪状甲状靱帯穿刺もしくは輪状甲状靱帯切開を行うべきとされる。すなわち輪状甲状靱帯切開を行い気管チューブまたは気管切開用のカニューレを入れるのがベストチョイスのようだ。

ミニトラック、トラヘルパーという小道具もある。

上のミニトラックというのは、時々使うことがあったが、緊急時には下のトラヘルパーのほうが良いことになっている（換気量が違う）。こんな小道具も使えるようになっておいた方がよいが・・・・・・・

でも小生など緊急時であれば輪状甲状靱帯切開をいきなり行い、メスで靱帯に切り込み、ついでペアンを突っ込み横・縦・横に広げカニューレをつっこんだ方が、個人的には「楽」だと思う。メスとペアンとカニューレがあればできるので。

気管切開用のカニューレ（細いヤツ）が病院のどこにあるのか、緊急トレイに確実に積んであることをいつも確認しておこう。

経験者が多く語るように、こんな緊急時には消毒も、止血も、麻酔も、清潔さも不要である。一秒でも早く酸素を脳に届けることだけ考えておけば良い。


誰かが書いているが

「できなくてもやらねばならぬ時もあります。あとは腹をくくって、覚悟を決めるだけです。がんばってください。」

まさにその通りである。 

医師の中には「カッターナイフとペアンはポケットに常備している」と述べている方がいる。そんな環境で医業を続けられていることに敬服するとともに今の自分には無理だと思う。

しかしそんな小生であるが何歳になっても、必要とあれば遅れることなく緊急気道確保だけは一発でできるようにしておきたいと思いまとめてみた次第である。

https://www.youtube.com/watch?v=chBsYiza1ik


https://www.youtube.com/watch?v=_HAPbahHUAA
メスとペアン、気管チューブ。JATECで習う方法と同じ。

年末の書棚整理の合併症

年末の書棚整理をこのところやっている。家人からは「捨てろ、捨てろ」の猛チャージを毎年受けつつ生き残ってきた本たちであるので、なんとも愛着が残る本が多い（そうでない本のほうが圧倒的に多いのも事実である。いつか読むだろうと置いてある本）。書棚整理はなかなか進まないものである。あれもこれも読み直しちゃったりするからである。今回はまったのは高田正純さんの二冊の本である。一冊が25年、もう一冊が30年前に出版された本である。面白いのだ。すっごーく面白かった、今よんでも。
 

「ラップトップかかえて世界一周」というのは旅行記です。そしてルポルタージュなのだ。1990年というネット旧約聖書の時代にラップトップで情報を集めながら世界一周をしたのは世界で高田さんが初めてであろう。御本人がそう書いているので間違いない（？）。まずWWWがないから、現在のネットの概念がない。光ファイバー網はない。でもメールとデータベースアクセスは可能である。これを電話回線で行う。音響カプラを持って世界一周なのだ。一分間のアクセスが数百円の時代である。転送速度が遅いので、画面に文字が送り込まれていくのが目で追える時代だったよな、当時は。世界一周の飛行機周遊券だけを買い、あとは出たとこ勝負でホテルの予約から様々な案件をパソコンでやりながらの旅である。当時の最新鋭の技術が「どうだ！」と記述されているが、今読むと実に「レトロ」だったり、そこまで遅かったっけと思ったり、そんなことも出来なかったんだ！、と思いながら、でも高田さん凄いよ、当時のアレでソレだもの。ネット旧約聖書の列王紀といったところである。

一方同じ著者の「データベースを使いこなす」は今を去ること30年前のパソコン体験なのである。30年前のパソコンといえば、マッキントッシュが出たばかり、NECなら8001あるいは8801くらいであろうか。この時代にパソコンでアメリカのデータベースにアクセスしていた、メールチャットを楽しんでいた高田さんのお話である。正直「ラップトップ・・・」ほどの面白さはない。でも当時のチャットと今のLINEのグループはほとんど同じだし、あるいは小生はやらないけどTwitterやFacebookの原型・・・はしっかりそこにあるのだ。高田さんは誇らしげに「ニューヨークのMikeとチャットをやっているところにハンブルグのScwartzが割り込んできた・・・」なんて書いている。「見たことも逢ったったこともない連中だけど気心は知れている」というようなことも。買い直して読むほど面白い本ではないが、NECの9801はまだ出ていないころ、MS-DOSの時代であり、ネット旧約聖書の創世記に近い時代であり「考古学的」に読み直してしまった。

ゲノムシークエンスのギャップを埋めていく努力：nature

今年は私の興味に引っかかってくる論文がとても少なくて残念な年であった。（「おめーが段々ずれてきているだけだよ・・・」といわれるそこの貴方、あなたが全く正しいかもしれない今日この頃である）

 そんな中ヒトゲノムマップに残されたギャップを潰す試みをまとめた論文が最近natureに出た。

Nature (2014)

Received 03 July 2014 
Accepted 30 September 2014 
Published online 10 November 2014

Resolving the complexity of the human genome using single-molecule sequencing 

 Mark J. P. Chaisson, John Huddleston, Megan Y. Dennis,Peter H. Sudmant,Maika Malig, Fereydoun Hormozdiari, Francesca Antonacci, Urvashi Surti, Richard Sandstrom,Matthew Boitano,Jane M. Landolin,John A. Stamatoyannopoulos, Michael W. Hunkapiller, Jonas Korlach & Evan E. Eichle

The human genome is arguably the most complete mammalian reference assembly, yet more than 160 euchromatic gaps remain, and aspects of its structural variation remain poorly understood ten years after its completion. To identify missing sequence and genetic variation, here we sequence and analyse a haploid human genome (CHM1) using single-molecule, real-time DNA sequencing. We close or extend 55% of the remaining interstitial gaps in the human GRCh37 reference genome—78% of which carried long runs of degenerate short tandem repeats, often several kilobases in length, embedded within (G+C)-rich genomic regions. We resolve the complete sequence of 26,079 euchromatic structural variants at the base-pair level, including inversions, complex insertions and long tracts of tandem repeats. Most have not been previously reported, with the greatest increases in sensitivity occurring for events less than 5 kilobases in size. Compared to the human reference, we find a significant insertional bias (3:1) in regions corresponding to complex insertions and long short tandem repeats. Our results suggest a greater complexity of the human genome in the form of variation of longer and more complex repetitive DNA that can now be largely resolved with the application of this longer-read sequencing technology.


 ゲノムプロジェクトが終了して（公的にクリントンが終了）10年が経つが、いまだ正確には人1人の完璧なゲノムシークエンス情報は知られていないのが現実だ。いまだに染色体は1本に繋がっていない。当たり前じゃないか、テロメアやセントロメアの反復配列につきあっているヒマはないんだ、意味ないし、といわれるそこの貴方。貴方はよほどひねているか、あるいはロマンが足りない。 

一番染色体を想像してみてほしい。一番染色体は端から端まで二本鎖DNAが延々と伸びている構造をしている（はずだ）。短腕のテロメアの端から反復配列が延々と続き、やがて最初の遺伝子構造が現れる。しばらく無意味な配列が続き次いで二番目の伝子構造が現れる。そのうち再び反復配列の森林に入り込むがこれがセントロメア配列である。どれくらいの長さ続くのか判然としないが動原体がくっつく部分を越えて長腕側に移りしばらくセントロメア配列が続いたのちに長腕最初の遺伝子が始まり延々と遺伝子が続き長腕最後の遺伝子が現れた後にテロメア反復が続いて一番染色体は終わる。 

この一連の配列にはいまだに配列構造が判明していない欠落部分がいくつも存在するのである。ここがなかなか埋められないのはシークエンスが難しいからだとされる。ゲノム全体ではユークロマチン領域に限定しても160カ所の欠落部分が存在するとされる。（ヘテロクロマチンの欠落は言わずもがなである）

 ゲノムシークエンスが技術的に困難な理由はいくつか知られているが、（１）サブクローンが取れないこと（２）反復配列の存在、は広く知られている。サブクローンとは数百キロbpのヒトゲノムDNAフラグメントが入ったクローニングベクターのことである。サンガーシークエンス（あるいはBAC、 PAC contigでゲノムを橋渡ししながら繋いでいく）するためにはこれを大腸菌で増やさなくてはいけないのだが、大腸菌に害毒を及ぼすシークエスというものがあるらしく、そういった遺伝子を含むクローンは増殖できないのだと説明されている　( toxic cloneの存在）。一方（２）反復配列は数百bp~数キロbpの単位で反復するが、これがシークエンスの端にあるとシークエンスやPCRが不可能となる。特異的にシークエンス開始点を決められない。ヒト染色体は2本あるが、反復配列のタンデムコピー数が違ったりすると全くシークエンスができない。かりにシークエンスできてもアラインメントが取れない。

今回の報告ではそのディプロイド性からくる複雑性を回避するためにハプロイドゲノムでしかも増幅可能なヒト絨毛性腫瘍細胞株（hydatidiform mole：胞状奇胎）をターゲットに選んでいる。 胞状奇胎とは脱核（あるいは核の不活化）した卵子に精子入り込み疑似受精が始まりハプロイドで細胞増殖が進みおおきくなる婦人科腫瘍である。（ブラックジャックのピノコは胞状奇胎由来だったはずだ。） この腫瘍から取られた細胞株があり、これは当然ハプロイド（精子由来）だからテンプレートとしてシークエンスがやりやすいのだ。 ターゲットはユークロマチンであるが、これで160カ所のうち60カ所以上が今回解決した。それでもあと100カ所以上のギャップがあるのだという。 

このような地道な努力には頭を下げたい。埋まってしまえばたわいもない構造・・・も多いのだが、いまだ未知のジャングルが残っているというのは、ロマンではあるが、掻靴掻痒でもある。早く決めてしまってください。

シークエンスレベルで最初の染色体構造が完成する日が訪れることを祈りたい。

追記：

最終著者の講演動画です。Evan Eichler, PhD / Howard Hughes Medical Institute, University of Washington

http://aa314.gondor.co/webinar/resolving-complexity-of-the-human-genome/

心筋梗塞はこわい、大動脈瘤もこわいぞ〜。

年末が近づいている。ますます外来が混んでくる。昨日の外来もお腹が痛い、頭を打った、切った、血が出た・・・と多くの患者さんがやってきた。

そんな患者さんたちの中にAさんが紛れ込んでいた。Aさんは当院は初診で問診票には「のむと胸が苦しい」と書いてある。56歳でバスの運転手。

「昨晩は久しぶりに娘夫婦と飲みまして、ビールを10缶くらいとブランデーを5杯くらい・・・」「眠っていたら夜中の1時頃から吐きたいような、吐けないような・・上腹部が痛くて、水を飲むときつい」とのこと。理学的には季肋部に圧痛がある。過去歴に胃潰瘍があるとのこと。高血圧・糖尿病などはない。常用薬はない。

いつもなら直ぐに内視鏡に案内するところだけど、なんか気になって心電図を撮ってみたところST上昇が僅かにあり、技師が「これcoronary Qではありませんか？」といやなことを言う。直ぐに緊急採血をしたところトロポニンが陽性である。小生たまたま反応を見ていたが4分で強陽性のバンド。

患者はといえば外来の椅子の上で文庫本を読んでいる。こちらの脇の下を冷たい汗が・・・。急いで救急室に運び、簡単に説明した後、酸素を始め、ルートを取ったころ残りの採血が出てくるがAST/ALTが3桁、 CPKは4桁であった。

PCIができる最寄りの病院に救急車で急いで搬送してもらった。長距離バスの運転手さんだというこの患者殿、これを機会に運転止めることを強くお薦めする。今回1人助けた（助かったと思う）が、後日30人のお客の生命が危険に晒されることにでもなれば浮かばれない。

今月は冷えることが多い。

月初めには44歳の腹部大動脈瘤の切迫破裂がやってきた。血管外科に送ったところその日のうちに手術をしてもらったが、開腹時には後腹膜にはかなりの血腫ができていたという。開腹の上グラフト置換であったが、幸い腎下部であり一週間後には退院して、再度当院に現れた。わたしゃ、幽霊をみたような気がしたが、とりあえず一安心である。血管外科には多謝。多謝である。ちなみにこの患者の主訴は「嘔気・嘔吐」であった。CT撮ってよかったという一例であった。臨床はスリリングである。

外来があと二日あるが、つつがなく大晦日を迎えられますように・・・アーメン！

難しく見えるけど好きな数学の問題

1. 無限の格子上（その座標が整数である点のことです）に、５つの点があります。これらの格子点の中から適当な2個を選ぶと、その2点の中点もまた格子点であることを証明しなさい（ 79年京大文系1番）。
    
2. 『平面上の６つの定点のうち任意の３点が作る三角形の重心と残りの３点が作る三角形の重心を通る直線は、３点の選び方にかかわらず一定の点を通ることを示せ』
   　
3. 『自然数５個からなる集合がある。この中から３個取りだし、その和が３の倍数にすることができることを証明せよ。』

この3つの問題の中で一番と3番は親戚のような問題である。3番は誰がみても予想できるように、結果を導くのに特別の知識が必要な問題ではない。それでも予見無く３番を解くのはかなり困難である・・・かもしれない。

この問題自力で解けたら、かなり自信がつくのではないかと思う。 数学の幅が随分広がると思われる。そういう意味では良問である。

姪や甥が今年は大学受験であるが、なかなかこんな問題解いてみろよ、とはいえない。解けるようになって欲しいがね。

史上もっとも引用された論文トップ100：nature

少し前にnatureが史上もっとも引用された論文トップ100なる特集を組んだ。トムソンに依頼して調べた引用データである。これについては、nature digestが日本語の要約を最近掲載したので興味のある方は参照されたい。このリストのトップ100に入るには一万2119回も引用されなくてはいけない。ブログ主なりにいくつか引用してみたい。

Rank: 1 Citations: 305,148
Protein measurement with the folin phenol reagent.
Lowry, O. H., Rosebrough, N. J., Farr, A. L. & Randall, R. J.
J. Biol. Chem. 193, 265–275 (1951).

Rank: 2 Citations: 213,005
Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4.
Laemmli, U. K.
Nature 227, 680–685 (1970).

Rank: 4 Citations: 65,335
DNA sequencing with chain-terminating inhibitors.
Sanger, F., Nicklen, S. & Couslon, A. R.
Proc. Natl Acad. Sci. USA 74, 5463–5467 (1977).

Rank: 5 Citations: 60,397
Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction.
Chomczynski, P. & Sacchi, N.
Anal. Biochem. 162, 156–159 (1987).

Rank: 6 Citations: 53,349
Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications.
Towbin, H., Staehelin, T. & Gordon, J.
Proc. Natl Acad. Sci. USA 76, 4350–4354 (1979).

以上はほぼ生化学・分子生物学の技術に関する論文である。上から Lowry法、Laemmli法、Sangerシークエンス法、超遠心から我々を解放してくれたRNA分離法、最後はウエスタン法である。

Rank: 10 Citations: 40,289
Clustal W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice.
Thompson, J. D., Higgins, D. G. & Gibson, T. J
Nucleic Acids Res. 22, 4673–4680 (1994).

ランク 10はいわゆる「ホモロジー検索」であり、見つけたDNA配列やアミノ酸配列の系統的意味づけのためのソフトウェアである。Doolittle教授がv-sisとPDGFのホモロジーを初めて発見した技術の現代進化バージョン

Rank: 11 Citations: 38,600
Nonparametric estimation from incomplete observations.
Kaplan, E. L. & Meier, P.
J. Am. Stat. Assoc. 53, 457–481 (1958).

われわれ臨床研究をやっている人間には欠かせないカプラン・マイヤーである。11位とは大したものであるが、最近は引用なんてするのかしら・・・ 
 

ちなみにCoxのregressionも24位で登場する

Rank: 24 Citations: 28,439
Regression models and life-tables.
Cox, D. R.
J. R. Stat. Soc., B 34, 187–220 (1972).

Rank: 12 Citations: 38,380
Basic local alignment search tool.
Altschul, S. F., Gish, W., Miller, W., Myers, E. W. & Lipman, D. J.
J. Mol. Biol. 215, 403–410 (1990).

Rank: 14 Citations: 36,410
Gapped BLAST and PSI-BLAST: A new generation of protein database search programs.
Altschul, S. F. et al.
Nucleic Acids Res. 25, 3389–3402 (1997).

 BLASTはこのあたり・・・

Rank: 19 Citations: 31,904
Detection of specific sequences among DNA fragments separated by gel-electrophoresis.
Southern, E. M.
J. Mol. Biol. 98, 503 (1975).

サザーン・ブロット

Rank: 20 Citations: 30,176
The neighbor-joining method: A new method for reconstructing phylogenetic trees.
Saitou, N. & Nei, M.
Mol. Biol. Evol. 4, 406–425 (1987).

生物種間の進化的距離を示す何らかの尺度（遺伝的多様性など）に従って多くの生物種の進化的関係を表現する「系統樹」を高速かつ効率よく作成できる「近隣結合法」という方法を提案した論文：斉藤成也：（テキサス大学ヒューストン校（現国立遺伝研）根井正利：（現ペンシルベニア州立大学教授）

Rank: 32 Citations: 23,421
The attractions of proteins for small molecules and ions.
Scatchard, G.
Ann. New York Acad. Sci. 51, 660–672 (1949).

 Scatchard法って懐かしくないですか・・？

Rank: 35 Citations: 23,011
Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival — application to proliferation and cyto-toxicity assays.
Mosmann, T.
J. Immunol. Methods 65, 55–63 (1983).

抗ガン剤のテストでこれやっている研究者は多かった・・・

Rank: 36 Citations: 22,899
Helical microtubules of graphitic carbon.
Iijima, S.
Nature 354, 56–58 (1991).

飯島博士の論文はここにきます。発見報告としてはかなり上位に位置します。

Rank: 40 Citations: 21,446
A technique for radiolabeling DNA restriction endonuclease fragments to high specific activity.
Feinberg, A. P. & Vogelstein, B.
Anal. Biochem. 132, 6–13 (1983).

Vogelsteinのおびただしい論文のなかでこの技術報告がトップにくることに驚かれる研究者は多いと思うが、彼がこの論文とシリカで核酸を共沈させる方法論（オリジナル版「エタ沈メイト」である）の報告論文を誇りに思っている旨のエッセイをその昔読んだことがある。技術屋としてのVogelsteinの面目躍如である。

Rank: 44 Citations: 18,489
High-resolution 2-dimensional electrophoresis of proteins.
O’Farrell, P. H.
J. Biol. Chem. 250, 4007–4021 (1975).

 O’Farrellの二次元電気泳動である。

Rank: 48 Citations: 17,220
Clinical diagnosis of Alzheimer’s disease: Report of the NINCDS-ADRDA Work Group under the auspices of Department of Health and Human Services Task Force on Alzheimer’s Disease.
McKhann, G. et al.
Neurology 34, 939–944 (1984).

ヒトの病気に関する論文ではトップに位置する。

Rank: 52 Citations: 17,025
Improved patch-clamp techniques for high-resolution current recording from cells and cell-free membrane patches.
Hamill, O. P., Marty, A., Neher, E., Sakmann, B. & Sigworth, F. J.
Pflug. Arch. Eur. J. Physiol. 391, 85–100 (1981).

 Neher, E., Sakmannによるパッチクランプ法である。電気生理学でノーベル賞。

Rank: 63 Citations: 15,160
Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase.
Saiki, R. K. et al.
Science 239, 487–491 (1988).

SaikiによるPCR法の論文である。この論文でマリスは最後から二番目の著者。サーマル・サイクラーはまだない。どうやってPCRをやっていたと思います・・・皆の衆？

Rank: 67 Citations: 14,934
Isolation of mononuclear cells and granulocytes from human blood.
Böyum, A.
Scand. J. Clin. Lab. Invest. 21, S77–S89 (1968).

リンパ球を分離するのにお世話になった方は多数いることであろう。（今引用するヒトはほとんどいない）

Rank: 78 Citations: 13,881
Use of avidin-biotin-peroxidase complex (ABC) in immunoperoxidase techniques: a comparison between ABC and unlabeled antibody (PAP) procedures.
Hsu, S.-M., Raine, L. & Fanger, H.
J. Histochem. Cytochem. 29, 577–580 (1981).

免疫染色華やかりしころ、このHsuの論文は大流行した。

Rank: 97 Citations: 12,391
Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity.
Köhler, G. & Milstein, C.
Nature 256, 495–497 (1975).

ケラーとミルシュテインの論文である。小生若い頃これとHsuには大変世話になった。

以上である。DNAのダブル・ヘリックスの論文などは高尚すぎるのか登場しないのである。

 

 

 

小豆島からNEJM：夕餉のあとの動悸

NEJMのimageには世界各地から症例報告が集まる。「出会い」と「志の高さ」が全てであり、医師としての自分がどこに所属するかは関係ないが、その医師に「志し」が無ければ縁はない。

小生日本からの症例報告には必ず反応するように心がけている（つもり）。今回の症例報告は小豆島・内海病院からである。内海と書いて「うちどみ」とよむ。この内海病院の黒河内和貴医師（現：島根大学医学部総合医療学講座　大田総合医育成センター教授）と香川大学医学部内分泌代謝・血液・内科・免疫・呼吸器内科　助教の今滝修医師の報告だ。

NEJMのイメージでは何回か登場する「横隔膜ヘルニア」であるが、心嚢気腫症や腎の内ヘルニアとともに記憶のどこかに止めておこう。

それにしても演目がしゃれている。

Palpitations after Dinner

病歴は一ヶ月だよ。動悸は時には昼飯や朝ご飯のあとにあってもおかしくないだろうに・・・・。あっぱれです。あなた方の勝ちです。(追記：dinnerは必ずしも晩御飯ではないんですね。晩御飯ならsupperか・・・。失礼しました）

それにしてもさすがはNEJMである。数日で23000人からの閲覧を集めて堂々の第二位である。

Images in Clinical Medicine

Palpitations after Dinner

Kazutaka Kurokohchi, M.D., Ph.D., and Osamu Imataki, M.D.

N Engl J Med 2014; 371:2320　December 11, 2014

A 76-year-old woman with rheumatoid arthritis, diabetes mellitus, and hypertension presented with a 1-month history of palpitations that occurred only after she had eaten dinner. The sensation was felt at the center of the chest and lasted for 10 to 15 minutes after the meal. An electrocardiogram was unremarkable. A chest radiograph (Panel A) showed a mediastinal shadow (white arrowheads) lateral to the left heart border (black arrowheads). Computed tomography of the chest revealed a left diaphragmatic hernia (Panel B), with the stomach positioned in the thorax (Panel C, coronal view), abutting the left ventricle (Panel D, axial view, arrowheads). The stomach was visibly twisted, a finding consistent with a gastric volvulus. Gastric endoscopy revealed a volvulus, with twisting of the mucosa. After surgical repair of the hernia and volvulus, the palpitations resolved, and at follow-up more than 1 year after surgery, the patient remained free of symptoms. 

Kazutaka Kurokohchi, M.D., Ph.D. Uchinomi Hospital, Shodoshima, Japan 
Osamu Imataki, M.D. Kagawa University, Kita, Japan oima@med.kagawa-u.ac.jp

両側のモンドール病：11例目

2年ぶりにMondor病の患者さんがやってきた。問診票には右乳腺が10日前から痛み、スジが張っているとある。あれ「右」ですか。当院外来でみるMondorは不思議なことに全員左なのだが、この方は右腋窩から乳頭に向かって全長8.5cmの血栓性静脈炎で疼痛と圧痛がある。36歳で当然「乳癌を心配して引きつって」やってきたのだが、「まったく問題ないです。3週間くらいで痛みが取れます」と案内しておいて、念のためエコーを行った。

「この病気うちの病院では10人が10人とも左にできるので、あなたは珍しいですよ」というと「実は右ほどではないけど、左にもあるんです」という。触診で確かに左にも静脈炎がある。ただし右ほど痛まない。両側性である。小生は初めて同時性の両側性Mondor病を診ました。

通算１１例目のMondor病であった。

と、ここまでで報告終わるはずであったが、「あのせんせ、こんなスジは他の場所にもできますか？」と最後の最後で問われてなんだか雲行きが・・・・

右の手掌の手関節に近いところ、それと右大腿外側にもあるんだとか・・・

全身性の血栓性静脈炎となるとちと困るが、おそらくそんな大それた病態ではないだろう。元気そうで熱もなさそう。再来してもらうことにした。

NEJM image：食道

サウジアラビアとエジプトからのイメージであるが、内視鏡あるいは切除標本写真が欲しかったと小生は思いますな。

N Engl J Med 2014; 371　December 11, 2014

Images in Clinical Medicine

Esophageal Duplication Cyst

Ahmed Abu-Zaid, M.B., B.S., and Ayman Azzam, M.D., Ph.D.

An otherwise healthy 23-year-old man presented with a 3-week history of difficulty swallowing solid food and associated vomiting. He reported no history of respiratory symptoms or weight loss. A barium-swallow examination showed substantial luminal narrowing of the distal esophagus (Panel A, arrows), and a focal mass effect could be seen anteriorly on a second projection (Panel B, arrows). Computed tomography (CT) of the chest performed after the administration of contrast material showed a well-defined, bilobed, cystic mediastinal mass measuring 7.3 cm by 3.2 cm by 7.0 cm. The mass was contiguous with the distal esophagus (Panel C, white arrows), which was immediately posterior to the mass and was compressed by it (Panel C, with the red arrow pointing to the expected location of the esophagus). Neither internal enhancement nor invasion of surrounding structures was seen on CT. The findings were most consistent with an esophageal duplication cyst. The patient underwent surgical resection of the cyst, and there were no indications of recurrence on a CT image obtained at a 2-month follow-up visit. Esophageal duplication cysts are uncommon, benign mediastinal masses. Most cases are diagnosed in infancy or childhood and involve the distal third of the esophagus. Complete surgical excision is typically curative, since recurrence is rare.

Ahmed Abu-Zaid, M.B., B.S.
Alfaisal University College of Medicine, Riyadh, Saudi Arabia
aabuzaid@live.com
Ayman Azzam, M.D., Ph.D.
Alexandria University Faculty of Medicine, Alexandria, Egypt

骨粗鬆薬プラリアとの劇的な出会い

この一年骨粗鬆症患者殿へDenosumab（日本名でプラリア）を投与することが多くなった。これはいわゆる分子標的薬の一つであり破骨細胞の形成、作用に不可欠なサイトカインであるRANKL（receptor activator of nuclear factor-κB ligand）に作用し、骨吸収を抑制し骨密度を増加する完全ヒトモノクローナル抗体である。

小生、実は当初プラリアの処方には懐疑的であった 。プラリアはモノクローナル抗体であり、ヒトにとってはある種の異種蛋白である。がん治療にモノクローナル抗体を用いることにはある種の妥当性があると考えるが、基本的に良性疾患であり、予防薬（骨折の予防）にすぎない抗骨粗鬆薬に異種蛋白（autoではないという意味である。alloでもいやだという意味）を投与するなどもっての他だと考えていたわけだ。

製薬会社からいくら薦められても「絶対に使わないぞ！」とかたくなに拒絶していた。

転機は今年の初めの腰椎圧迫骨折の Ａさんである。骨折を繰り返し疼痛がひどく、リハビリも進まず、本人も鬱気分であるが、対応する小生もうつになりそうであった。正直、朝の訪問がうっとうしくてならなかった。NSAIDsにリリカにノルスパンテープに抗うつ剤を加えても余り効果が無い。整形のドクターに助けを求めても、お手上げであった。

なにか今までにないドラスティックなことをやらなければと思い、ようやく「プラリア」のことを思い出した。痛みにも効くと説明を受けたからだ。

歯科的なことや血液Ｃａ濃度やその他のチェックを済ませて、初めて投与したのが今年の3月の上旬であった。正直怖かった。抗癌剤投与くらいなら全く鼻歌交じりだが、慣れない薬剤を最初に投与するというのは、とても恐ろしい。こわくてこわくてしょうが無い。

驚いたことに一日目、3日目に血清Ｃａ濃度が下がっていく。もちろん経口カルシウム製剤である「デノタス・チュラブル」の投与は併せて行っていたのだ。 Ｃａ濃度が下がっていくということは、粗鬆骨にカルシウムが吸収されていくことを意味している。なにか患者殿の体内でとんでもないことが起こっているような気がしたものだ。

実はその驚きはたいしたことではなかったのだ。最大のおどろきは患者が「痛みが消えた」と告げたことであった。あれだけ憂鬱な表情であった患者が投与3日目を境に、その後9ヶ月目の一昨日の外来まで全く痛みを訴えなくなったのだ。劇的であった。ノルスパンテープを止め、リリカを止め、抗うつ薬を止め、なんとロキソニンまでも止めるのに半月もかからなかったのだ。

そんな症例ばかりではないことも充分承知しているが、でもこの薬存外悪くない。第一半年に一回打てば良いというのが良い。確かに 「デノタス・チュラブル」経口摂取はうっとうしいが、でも患者はカルシウムは喜んで飲んでくれます。

いまではすっかり気に入っているのである。今日は「顎骨壊死」について調べてみた。これ最大の副作用なのだけど、実際どれくらいの頻度なのだろう。オリジナルの論文にあたってみた。2009年の有名な「FREEDOM試験」である。
驚いたことに、この論文では発生件数”0”なのである。 一番下の表であるが、コントロールもDenosumab投与群も（それぞれ3600例〜）一件の発生がないのである。若干安心した次第である。

追記：日本国内第Ⅲ相臨床試験において、歯科・口腔外科領域の医学専門家による中央判定で顎骨壊死と判定された事象が0.1%（1/881例）に認めらた。

さて本論。

N Engl J Med 2009; 361:756-765　August 20, 2009

Original Article

Denosumab for Prevention of Fractures in Postmenopausal Women with Osteoporosis

Steven R. Cummings, M.D., Javier San Martin, M.D., Michael R. McClung, M.D., Ethel S. Siris, M.D., Richard Eastell, M.D., Ian R. Reid, M.D., Pierre Delmas, M.D., Ph.D., Holly B. Zoog, Ph.D., Matt Austin, M.S., Andrea Wang, M.A., Stepan Kutilek, M.D., Silvano Adami, M.D., Ph.D., Jose Zanchetta, M.D., Cesar Libanati, M.D., Suresh Siddhanti, Ph.D., and Claus Christiansen, M.D. for the FREEDOM Trial

FREEDOM試験（Fracture Reduction Evaluation of Denosumab in Osteoporosis Every 6 Months）は、60～90歳の女性で腰椎または股関節の骨密度Tスコアが、－2.5未満（－4.0まで）の7,868例が参加し行われた。

被験者は無作為に、denosumab 60mg群とプラセボ群に割り付けられ、皮下投与が6ヵ月毎に36ヵ月間行われた。

主要エンドポイントは、X線上の新規の椎体骨折。副次エンドポイントは、非椎体および股関節の骨折とされた。

プラセボ群と比べてdenosumab群は、新規の椎体骨折リスク発生が相対的に68％低かった。累積発生率は、プラセボ群7.2％に対しdenosumab群2.3％で、リスク比は0.32（95％信頼区間：0.26～0.41、P＜0.001）。

股関節骨折もdenosumab群のほうが、相対的に40％低かった。累積発生率は、プラセボ群1.2％に対しdenosumab群0.7％で、ハザード比は0.60（同：0.37～0.97、P＝0.04）。

非椎体骨折もdenosumab群のほうが、相対的に20％低かった。累積発生率は、プラセボ群8.0％に対しdenosumab群6.5％で、ハザード比は0.80（同：0.67～0.95、P＝0.01）。

がん、感染症、心血管疾患、治癒の遅れ、低カルシウム血症のリスク増加は認められず、顎骨壊死例やdenosumabの投与有害反応はなかった。

抗癌剤一覧

抗癌剤名

ア

• アクチノマイシン （コスメゲン）
• アスパラギナーゼ （ロイナーゼ）
• アムルビシン （カルセド）
• アレクチニブ（アレセンタ）
• アファチニブ（ジオトリフ）
• イフォスファミド （イホマイド）
• イマチニブ （グリベック）
• イリノテカン （カンプト）
• エトポシド （ベプシド）
• エピルビシン （ファルモルビシン）
• エリブリン（ハラヴェン）
• オキサリプラチン （エルプラット）
• エルロチニブ （タルセバ）

カ

• カルボプラチン （パラプラチン）
• カペシタビン（ゼローダ）
• カバジタキセル（ジェブタナ）
• クリゾチニブ（ザーコリ）
• ゲフィチニブ（イレッサ）
• ゲムシタビン （ジェムザール）

サ

• シクロホスファミド （エンドキサン）
• シスプラチン（ランダ、アイエーコール）
• シタラビン （キロサイド）
• セッキシマブ（アービタックス）
• ソラフィニブ（ネクサバール）
• スニチニブ（スーテント）

タ

• ダカルバジン （ダカルバジン）
• ダサチニブ（スプリセル）
• テモゾロミド （テモダール）
  
• ドキソルビシン （アドリアシン）
• ドセタキセル （タキソテール）
• トラスツズマブ （ハーセプチン）
• トラスツブマブエムタイシン （カドサイラ）
• トリフルリジン・チピラシル（ロンサーフ）

ナ

• ニムスチン （ニドラン）
• ネダプラチン （アクブラ）
• ノギテカン （ハイカムチン）

ハ

• パニツムマブ （ベクチビックス）
• パクリタキセル （タキソール）（アブラキサン）
• ビノレルビン （ナベルビン）
• ビンクリスチン （オンコピン）
• ビンブラスチン （エクザール）
• フルオロウラシル （5-FU）
• ブレオマイシン （ブレオ）
• ベバシズマブ （アバスチン）
• ペメトレキセド （アリムタ）
• ベルツズマブ（パージェタ）

マ

• マイトマイシン （マイトマイシン）
• メトトレキサート （メトトレキサート）
• メルファラン （アルケラン）

ラ

• ラパチニブ （タイケルプ）
• リツキシマブ （リツキサン）
• レボホリナート （ロイコボリン、アイソボリン）
• レゴラフェニブ （スチバーガ）
• リポソーマルドキソルビシン(ドキシル)

• FOLFOX療法
• FOLFIRI療法
• IRIS療法
• XELOX療法
• FOLFIRINOX療法
• CMF療法
• CAF療法
• AC療法
• AC-T療法　
• TS-1（ティーエスワン）
• UFT

ホルモン

• ゴセレリン（ゾラデックス）
• リュープロレリン（リュープリン）
• エキセメスタン（アロマシン）
• アナストロゾール（アリミデックス）
• レトロゾール（フェマーラ）
• タモキシフェン（ノルバデックス）
• トレミフェン（フェアストン）
• クロルマジン（プロスタール）
• フルタミド（オダイン）
• ビカルタミド（カソデックス）
• エチニル（プロセキソール）
• エンザルタミド（イクスタンジ）
• デガレリスク（ゴナックス）
• アビラテロン（ザイティガ）

nivolumab：ホジキン病への抗PD-1抗体治療：信じがたい効果-NEJM

抗PD-1抗体の治療効果については多くの報告があるが、今回ホジキン病の報告が出た。普通であれば治療不成功としてBSCに回るような患者さん達にここまでの効能（完全寛解をこの段階から得るのである）が出るとすれば素晴らしい。にわかには信じがたいが、でも本当なのだろう。

3レジメ以上の治療(多くはbrentuximab vedotinもだめだった）に失敗し、自家造血幹細胞移植も失敗したホジキン病患者23名に抗PD-1抗体 [ nivolumab ](ブリストル・マイヤーのOpdivo）を投与したところ87％（20名）に治療効果を認め、17%(4名)にCR(complete response)、70％(16名）にPR(partial response)を認めたというものである。フォローアップは40週。

なおPD-1のオリジナリティーは京都大学　本庶先生の教室から1992年に石田さんが発表された下記論文に由来する。

• Abstract The classical type of programmed cell death is characterized by its dependence on de novo RNA and protein synthesis and morphological features of apoptosis. We confirmed that stimulated 2B4.11 (a murine T-cell hybridoma) and interleukin-3 (IL-3)-deprived LyD9 (a murine haematopoietic progenitor cell line) died by the classical type of programmed cell death. Assuming that common biochemical pathways might be involved in the deaths of 2B4.11 and LyD9, we isolated the PD-1 gene, a novel member of the immunoglobulin gene superfamily, by using subtractive hybridization technique. The predicted PD-1 protein has a variant form of the consensus sequence found in cytoplasmic tails of signal transducing polypeptides associated with immune recognition receptors. The PD-1 gene was activated in both stimulated 2B4.11 and IL-3-deprived LyD9 cells, but not in other death-induced cell lines that did not show the characteristic features of the classical programmed cell death. Expression of the PD-1 mRNA in mouse was restricted to the thymus and increased when thymocyte death was augmented by in vivo injection of anti-CD3 antibody. These results suggest that activation of the PD-1 gene may be involved in the classical type of programmed cell death. 

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Nivolumab (anti-PD-1; BMS-936558; ONO-4538) 

• 小野薬品の説明によると・・ニボルマブは、2005年5月に、当社と米国メダレックス社が締結した共同研究契約に基づき創製された完全ヒト型抗PD-1抗体です。その後、メダレックス社が2009年にブリストル・マイヤーズスクイブ（以下、BMY社）に買収された際に、この抗PD-1抗体の北米における開発・商業化権はBMY社に継承されました。そして、2011年9月に当社とBMY社が締結した戦略的なライセンス契約において、当社はニボルマブについて北米以外の地域のうち、当社が開発・商業化の権利を留保する日本・韓国・台湾を除く全世界において独占的に開発・商業化する権利をBMY社に供与しました。

ホジキンに関してはこの治療薬が抗免疫フェースでの効果以外の機構がありそうでもあるが、いずれにせよ素晴らしい。

2014年は免疫治療の年であった。

December 6, 2014

PD-1 Blockade with Nivolumab in Relapsed or Refractory Hodgkin's Lymphoma

Stephen M. Ansell, M.D., Ph.D., Alexander M. Lesokhin, M.D., Ivan Borrello, M.D., Ahmad Halwani, M.D., Emma C. Scott, M.D., Martin Gutierrez, M.D., Stephen J. Schuster, M.D., Michael M. Millenson, M.D., Deepika Cattry, M.S., Gordon J. Freeman, Ph.D., Scott J. Rodig, M.D., Ph.D., Bjoern Chapuy, M.D., Ph.D., Azra H. Ligon, Ph.D., Lili Zhu, M.S., Joseph F. Grosso, Ph.D., Su Young Kim, M.D., Ph.D., John M. Timmerman, M.D., Margaret A. Shipp, M.D., and Philippe Armand, M.D., Ph.D.

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ASCT：autologous stem-cell transplantation

ブレンツキシマブ ベドチン（brentuximab vedotin）は抗CD30モノクローナル抗体に微小管阻害薬のモノメチルアウリスタチンEが結合した分子標的治療薬であり、アドセトリス（Adcetris）として武田薬品から販売

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1千億フレーム/秒のシングルショット超高速圧縮写真撮影法：nature 最新号

医学生物学情報を補完するためにnatureを読んでいるが、時にとんでもなくスリリングな情報に出会うことがある。

今回のこの「1千億フレーム/秒のシングルショット超高速圧縮写真撮影法 」ってなんか凄くない？

10 ¹¹ フレーム/秒というが光の速度は3 x 10 ¹¹ mm /秒なのでワンショットで3 mm進む光が捉えられることになる（はずだ）（というようなことは瞬時に計算できる）これって凄くない？

でももっと凄いのは下の三番目の光より速い非情報伝搬（すなわち光の速度よりも速く見えるが情報を伝達できない運動）
を可覗化するという記述である。ＳＦ的で今話題の映画「Interstellar」のようで愉しくない？

この図解が「光より早い移動」と「情報が伝達できない」状況を示しているらしい。この単純な実験系と説明についてお分かりの方がおられたら説明してください。私にはなんのことやら・・・・

 



















Nature 516, 74–77 (04 December 2014) 

Received 23 June 2014
Accepted 17 October 2014
Published online 03 December 2014

Single-shot compressed ultrafast photography at one hundred billion frames per second 

 Liang Gao, Jinyang Liang, Chiye Li 　& Lihong V. Wang

以下日本語要約である。

速い撮像速度で過渡的なシーンを捉えることは、写真家の念願であった。初期の例として、1878年の走る馬の有名な記録や、1887年の超音速の弾丸の写真がある。しかし、飛躍的進歩の実現には、20世紀後半になって10 ⁵ フレーム/秒を超える超高速撮像が実証されるまで待たなければならなかった。特に、電荷結合素子（CCD）や相補型金属酸化膜半導体（CMOS）技術を利用した電子撮像センサーの導入が高速写真撮影に大変革を起こし、最高で10 ⁷ フレーム/秒の取得速度の実現が可能になった。これらのセンサーが広範な影響を及ぼしたにもかかわらず、CCDやCMOS技術を用いたフレームレートのさらなる増加は、オンチップ記憶速度や電子的読み出し速度によって根本的に制限されている。今回我々は、最高10 ¹¹ フレーム/秒で非反復的時間発展事象を捉えることができる圧縮超高速写真撮影法（CUP）という二次元動的撮像法を実証している。既存の超高速撮像法と比較すると、CUPには、単一カメラスナップショットで x – y – t （ x と y は空間座標、 t は時間）シーンを測定することにより、数十ピコ秒の時間分解能で過渡事象の観察が可能になるという顕著な利点がある。さらに、従来の写真撮影法と同様に、 CUPは受光専用なので、他の超高速シングルショット撮像装置に必要な特殊な能動照明は不要である。従って、CUPは、蛍光体や生物発光体などのさまざま な発光体を撮像することができる。

我々はCUPを用いて、単一レーザーショットのみで、

1. レーザーパルスの反射と屈折、
2. 2つの媒質における光子の競争、
3. 光より速い非情報伝搬（すなわち光の速度よりも速く見えるが情報を伝達できない運動）

という4つの基礎物理現象を可視化している。CUPの能力を考えると、生 物医学研究など、基礎科学と応用科学の両方で広範な応用が見いだされると我々は予想している。