PTENのintron２に巨大な反復構造

Recurrent gross mutations of the PTEN tumor suppressor gene in breast cancers with deficient DSB repair

類をみない面白さである、この論文。核心はこのFISHの絵であろう。PTENのintron２に巨大な反復構造が嵌り込んで結果遺伝子を壊しているのだ。この大きさでは従来のCGHやkaryotypingでは見つけることができない。もちろんエクソンシークエンスでは全く突然変異はみつからない。蛋白レベルでは発現が消失しているのだ。メチレーションもかかっていない。こんな遺伝子消失パターンがあるのだね。それも複数の症例で観察されるのだ。昔、血友病の遺伝子にLINE１が飛び込んだ症例報告がNatureに載ったが、あれ以来久しぶりの興奮である。やはりゲノム解析は癌の研究においてますます重要と考えるのだ。

Haemophilia A resulting from de novo insertion of L1 sequences represents a novel mechanism for mutation in man:

Nature 332, 164 - 166 (10 March 1988)